Last updated on 2022-09-11 12:56:25 CEST.
| Flavor | Version | Tinstall | Tcheck | Ttotal | Status | Flags |
|---|---|---|---|---|---|---|
| r-devel-linux-x86_64-debian-clang | 1.3.17 | 25.87 | 49.17 | 75.04 | NOTE | |
| r-devel-linux-x86_64-debian-gcc | 1.3.17 | 22.26 | 38.19 | 60.45 | NOTE | |
| r-devel-linux-x86_64-fedora-clang | 1.3.17 | 110.90 | NOTE | |||
| r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc | 1.3.17 | 118.36 | NOTE | |||
| r-devel-windows-x86_64 | 1.3.17 | 103.00 | 116.00 | 219.00 | ERROR | |
| r-patched-linux-x86_64 | 1.3.17 | 26.72 | 48.91 | 75.63 | OK | |
| r-release-linux-x86_64 | 1.3.17 | 26.44 | 49.19 | 75.63 | OK | |
| r-release-macos-arm64 | 1.3.17 | 31.00 | NOTE | |||
| r-release-macos-x86_64 | 1.3.17 | 41.00 | NOTE | |||
| r-release-windows-x86_64 | 1.3.17 | 36.00 | 109.00 | 145.00 | ERROR | |
| r-oldrel-macos-arm64 | 1.3.17 | 31.00 | OK | |||
| r-oldrel-macos-x86_64 | 1.3.17 | 40.00 | NOTE | |||
| r-oldrel-windows-ix86+x86_64 | 1.3.17 | 68.00 | 137.00 | 205.00 | OK |
Version: 1.3.17
Check: package dependencies
Result: NOTE
Package suggested but not available for checking: 'lfa'
Flavors: r-devel-linux-x86_64-debian-clang, r-devel-linux-x86_64-debian-gcc, r-devel-linux-x86_64-fedora-clang, r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc, r-release-macos-arm64, r-release-macos-x86_64, r-oldrel-macos-x86_64
Version: 1.3.17
Check: tests
Result: ERROR
Running 'testthat.R' [11s]
Running the tests in 'tests/testthat.R' failed.
Complete output:
> library(testthat)
> library(popkin)
>
> test_check('popkin')
OS - Alias wurde nicht gefunden.
OS - Alias wurde nicht gefunden.
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OS - Alias wurde nicht gefunden.
OS - Alias wurde nicht gefunden.
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[ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]
══ Failed tests ════════════════════════════════════════════════════════════════
── Failure (test_popkin.R:250:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
`obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
── Failure (test_popkin.R:255:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
`obj <- popkin_A(X + 0)` produced warnings.
── Failure (test_popkin.R:260:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
`obj <- popkin_A(2L - X)` produced warnings.
── Failure (test_popkin.R:265:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
`obj <- popkin_A(2 - X)` produced warnings.
── Failure (test_popkin.R:271:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
`obj <- popkin_A(X, m_chunk_max = 1)` produced warnings.
── Failure (test_popkin.R:413:5): function returns precomputed values: popkin ──
`obj <- popkin(X, want_M = TRUE)` produced warnings.
── Failure (test_popkin.R:417:5): function returns precomputed values: popkin ──
`obj <- popkin(X, subpops, want_M = TRUE)` produced warnings.
── Failure (test_popkin.R:956:5): popkin_af works ──────────────────────────────
`coancestry2 <- popkin_af(P)` produced warnings.
── Failure (test_popkin.R:961:5): popkin_af works ──────────────────────────────
`obj <- popkin_af(P, want_M = TRUE)` produced warnings.
── Failure (test_popkin.R:968:5): popkin_af works ──────────────────────────────
`coancestry2 <- popkin_af(P_miss)` produced warnings.
── Failure (test_popkin.R:973:5): popkin_af works ──────────────────────────────
`obj <- popkin_af(P_miss, want_M = TRUE)` produced warnings.
── Failure (test_popkin.R:980:5): popkin_af works ──────────────────────────────
`obj2 <- popkin_af(t(P_miss), want_M = TRUE, loci_on_cols = TRUE)` produced warnings.
── Failure (test_popkin_BEDMatrix.R:17:9): function returns precomputed values: popkin_A ──
`obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
── Failure (test_popkin_fn.R:34:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
`obj <- popkin_A(Xf, n = n)` produced warnings.
[ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]
Error: Test failures
Execution halted
Flavors: r-devel-windows-x86_64, r-release-windows-x86_64