Obrigado por utilizar o pacote ExpImage
. Este pacote foi desenvolvido a fim de facilitar o uso da analise de imagens na obtenção de várias informações sobre os objetos que elas contém. Para a utilização do pacote é indispensável a instalação do pacote EBImage
. Geralmente, este pacote pode ser instalado ao executar os seguintes comandos:
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("EBImage")
Porém se houver problemas na instalação sugerimos que consulte mais opções de instalação no site: https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/EBImage.html
Para instalar o pacote ´ExpImage´ basta utilizar o seguinte comando:
install.packages("ExpImage")
Convidamos a todos os usuários do ExpImage que venha conhecer nossos materiais didáticos sobre este e outros pacotes nos seguintes links:
Após a instalação dos pacotes é necessário fazer sua ativação
library(EBImage)
library(ExpImage)
Para abrir as imagens pode-se inicialmente indicar a pasta de trabalho onde a imagem se encontra com a função setwd
. E, posteriormente, abrir a imagem com a função read_image
.
Neste caso, poderiam ser utilizados comandos como esses:
#Apagar memoria do R
remove(list=ls())
#Indicar a pasta de trabalho
setwd("D:/Backup Pendrive/")
im=read_image("Imagem.jpeg",plot=TRUE)
Neste exemplo utilizaremos uma imagem contida no banco de dados do pacote.
# Obtendo o endereço da imagem de exemplo
=example_image(1)
end=read_image(end,plot=TRUE) im
Em algumas situações, torna-se necessário efetuar a edição das imagens, cortando-as e alterando brilho, contraste, etc.
##Diminuir a resolucao (tamanho da imagem)
=resize_image(im,w=1000,plot=TRUE) im2
##Cortar Imagem
=crop_image(im2,w =200:650,h=100:450,plot = TRUE) im3
##Aumentar brilho
=edit_image(im3,brightness = 0.1,plot = TRUE) im4
#Aumentar contraste
=edit_image(im4,contrast = 1.2,plot = TRUE) im5
#Aumentar gamma
=edit_image(im5,gamma = 1.1,plot = TRUE) im6
#Alterando brilho, contraste e gamma
=edit_image(im3,brightness = 0.1,contrast = 1.7,gamma = 1.2,plot = TRUE) imb
imb#> Image
#> colorMode : Color
#> storage.mode : double
#> dim : 451 351 3
#> frames.total : 3
#> frames.render: 1
#>
#> imageData(object)[1:5,1:6,1]
#> [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6]
#> [1,] 0.2014256 0.2138706 0.2038370 0.2221603 0.2387216 0.2018971
#> [2,] 0.1933155 0.2282193 0.2145809 0.2212601 0.2268771 0.2077957
#> [3,] 0.1960527 0.2070359 0.2216802 0.2140484 0.2064617 0.2046473
#> [4,] 0.1955435 0.1964947 0.2135965 0.2075519 0.2012866 0.2011161
#> [5,] 0.1955435 0.1961775 0.2055566 0.1968622 0.1933271 0.1983939
Também é possível excluir o background da imagem. Para isso, deve-se primeiro fazer uma segmentação.
#Extração da banda
=gray_scale(imb,method = "r",plot=TRUE) r
#Segmentação
=segmentation(r,treshold =0.2,selectHigher = TRUE,fillHull = T,plot = TRUE ) seg
#Remoção do background
=extract_pixels(imb,target = seg,valueTarget = 1,valueSelect = c(0,1,0),plot = TRUE) imc